本儀器工作原理是：將原始樣本（大的需要剪成約10×10mm塊狀），與某種液體或溶劑放入均質袋，經本儀器的錘擊板反復在樣品均質袋上錘擊，產生壓力、引起振蕩、加速混合、從而達到溶液中微生物成分處于均勻分布狀態。本儀器適用于腦、腎、肝、脾等組織及微生物的均質處理，廣泛應用于食品、藥品、臨床、分子學、毒素及細菌檢測等領域。
無菌均質器正確使用步驟為：
1、把需處理的試品放入無菌均質袋中。
2、打開均質器門(可全開啟)，將無菌袋開口在關閉均質器門時夾住。
3、設定使用程序(如拍擊速度、拍擊時間等)，進行拍擊均質工作。
4、實驗完畢后，打開均質器門，取出樣品。
無菌均質器的使用如果做到以上幾點，可以極大延長其使用壽命和使用效果。
拍擊式均質器主要用于生物技術領域的組織分散、醫藥領域的樣品準備、食品工業的酶處理以及在制藥工業、化妝品工業、油漆工業和石油化工等方面。
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